1986年，横须贺，在位于郊外的某个柔术馆“芭月武馆”中出现了神秘的男性的身影。道场教练芭月严在与身着深绿色的中国服装的男子的对峙过程中，被对方以绝对的优势击倒在地。连冲进来救助父亲的凉也被对方所控制。 “镜子在哪里？”将凉挟持为人质的男子厉声问道。被逼无奈的父亲严只能告诉了他。手持刻有龙纹“铜镜”的神秘男对严说“你还记得你杀死的赵孙明吧”，然后给了严致命一击。 那个手持铜镜离去的男子被其部下称为“蓝帝”，在他的后背上龙的刺青闪耀着妖异的光。“学会爱、重视朋友…”严的遗言激荡在凉的胸中，凉誓言报仇，从

阿尔扎诺帝国帝国魔术学院的兼职讲师格伦·勒达斯是假自习之名行打瞌睡之实的惯犯。就算难得站上了讲台，他也是专搞直接把课本钉在黑板上之类的花招，耍废的程度连学生也不以为然。被这样的格伦惹恼的学生──有着“师见愁”之名的希丝缇娜·菲伊贝鲁向他提出了决斗。结果令人遗憾地，格伦以悬殊的差距吞下了败战……然而学校发生了前所未有的恐怖事件，学生也无一幸免地受到了波及。“不许伤害我的学生！”如此说的格伦于此时发挥了真正的本领！

结果战争并没有消失。 但是有了变化。在人类默默进行无聊的彼此杀戮之中产生变化。 超大型武器——OBJECT。 它的出现改变了战争的一切。 派遣到战场留学的学生，库温瑟，在整备基地遇见带着奇妙氛围的少女。人称“ELITE”的那名少女——正是“OBJECT”的驾驶员。 在不久的将来，这名微不足道的少年将会为了这名少女，以个人的血肉之躯对抗最强的武器“OBJECT”。 这次邂逅就是一切的开端——

远月学园迎来秋季选拔，获得选拔资格的创真迎来新的挑战。

　　由于童年的悲惨遭遇，直枝理树（堀江由衣 配音）的个性变得十分孤僻。长着一张娃娃脸，沉默寡言，没有朋友，这样的理树成为了大家眼里的怪胎。某一日，性格傲娇爱猫如命的枣铃（民安智惠 配音），正直开朗稳重可靠的枣恭介（绿川光 配音），四肢发达头脑简单的井之原真人（神奈延年 配音），成熟勇敢剑术一流的宫泽谦吾（织田优成 配音）四人出现在了绝望的理树面前。他们自称“Little Busters”，想要利用理树的力量来完成拯救世界的重任。 　　就这样，理树成为了LB中的一份子，整日奔波解决一些说来宏大但其实十分平

　　幼时曾深陷绝望深渊的直枝理树，与4位少年少女相遇了。 　　在那之后数年，理树作为Little Busters的一员，喧闹地过着快乐的每一天。 　　这样的时间能够一直持续就好了。理树所期望的只有这样。 　　某日，恭介突然表示要成立一支棒球队伍， 　　理树则开始了寻找成员的任务。 　　在这样的过程中，理树邂逅了新的成员们。 　　和大家一起参加试胆大会，潜入女生宿舍时被换上女装，一起演人偶剧……。 　　经历了许多快乐的事情， 　　同时也在大家的帮助下解决了各自拥有的烦恼。 　　最后在棒球比