宫小路瑞穗（堀江由衣 配音）是个地地道道的男孩子，可是由于祖父的奇怪遗言，他即将转学到圣央女学院开始新的学习生活。祖父的用意为何？瑞穗完全不知道。圣央女学院是一所完全的女校，有其严明的校风和校规，是女孩子们学习如何成为一名真正淑女的宝地。对于从小就接受着良好教育的瑞穗来说，这一切都不是问题。唯一困扰着他的，是如何打扮成女生而不被发现，和怎样应付周围那一群如花似玉的大小姐。 　　成熟端庄的十条紫苑（松来未佑 配音），单纯善良的周防院奏（神田朱未 配音），活泼好动的御门玛利亚（浅野真澄 配音），傲娇腹黑

　　故事发生在一个小镇上，冈崎朋也（中村悠一 配音）是光坂高中在校生，因为家庭原因他一直过着浑浑噩噩的生活。他不参加任何社团活动，唯一的朋友是春原阳平（阪口大助 配音）。 　　某天的上学途中，在樱花飞舞的坡道上，他邂逅了一名少女——古河渚（中原麻衣 配音），从此他的生活发生改变。渚因病休学一年，重返校园的她对周围环境感到相当不适应。她想加入戏剧部，然而戏剧部早已休部。朋也决定帮助她一起开展戏剧部的活动，二人关系变得越发亲密。随后不久朋也在图书馆中结识了一名天才少女一之濑琴美（能登麻美子 配音）。 　　

在某个小镇，主角冈崎朋也因家庭因素成为不良少年，一直与春原阳平为伍，在光坂高校过着潦倒的生活，但冀望终有一天能够离开所在的小镇。某一天，他在学校坡道前发现了一个止步不前的女孩，在朋也认识了这个名为“古河渚”的女孩后，他的生活开始有了重大的变化。

故事背景以被埃雷波尼亚帝国及卡尔瓦德共和国所包围的利贝尔王国为主舞台，在这个经历革命後的新富饶时代，导力器技术相当发达，利用导力器技术所研发出来的各式各样的机械产品，为人们带来了富裕且便利的生活，渐渐地，导力器技术成为了能量的核心，也成为了日常生活中无可替代的存在。与此同时，部份强国也开始研究开发导力器兵器，暗中策划一场大陆霸权的争夺战，因而衍生出各种混乱，於是「游击士」便出现了。 游击士是在大陆各地开设支部据点的工会，他们以保护民众安全与地域和平为第一目标，并派遣游击士进行消灭魔兽、犯罪等相关工作

　　由于童年的悲惨遭遇，直枝理树（堀江由衣 配音）的个性变得十分孤僻。长着一张娃娃脸，沉默寡言，没有朋友，这样的理树成为了大家眼里的怪胎。某一日，性格傲娇爱猫如命的枣铃（民安智惠 配音），正直开朗稳重可靠的枣恭介（绿川光 配音），四肢发达头脑简单的井之原真人（神奈延年 配音），成熟勇敢剑术一流的宫泽谦吾（织田优成 配音）四人出现在了绝望的理树面前。他们自称“Little Busters”，想要利用理树的力量来完成拯救世界的重任。 　　就这样，理树成为了LB中的一份子，整日奔波解决一些说来宏大但其实十分平

　　幼时曾深陷绝望深渊的直枝理树，与4位少年少女相遇了。 　　在那之后数年，理树作为Little Busters的一员，喧闹地过着快乐的每一天。 　　这样的时间能够一直持续就好了。理树所期望的只有这样。 　　某日，恭介突然表示要成立一支棒球队伍， 　　理树则开始了寻找成员的任务。 　　在这样的过程中，理树邂逅了新的成员们。 　　和大家一起参加试胆大会，潜入女生宿舍时被换上女装，一起演人偶剧……。 　　经历了许多快乐的事情， 　　同时也在大家的帮助下解决了各自拥有的烦恼。 　　最后在棒球比