蜂之妖怪远去，不死鸟的妖怪则是逃过一劫的暑假结束了—— 　　迎接新学期的阿良良木历和少女们，怪异，甚至是比这还可怕的威胁悄然地接近他们。 　　羽川翼、八九寺真宵、神原骏河、千石抚子、忍野忍，以及战场原黑仪。 　　她们的独白以及告白——还有告别。 　　6个新“故事”，现在揭开序幕了。 　　《物语系列 2nd season》是改编自西尾维新原作的轻小说《物语系列》的电视动画，内容包括《物语系列》中的《猫物语（白）》、《倾物语》、《囮物语》、《鬼物语》和《恋物语》等五部作品。

在和美丽吸血鬼遭遇的春假之后，主人公阿良良木历迎来新学期，从新学期的第1个月开始到大学入学考试为止，这1年间每个月所经历的故事。