寄宿着昔日舰艇之魂的少女们，是谓“舰娘”。对于深海而来被称作敌对舰艇集群“深海栖舰”的异形敌人，舰娘是唯一能同他们对抗的存在。她们投身于战斗，保卫着人们和大海。然而，面对深海栖舰压倒性的数量优势，舰娘们非死即伤，战局不断倒向深海一方。此时，驱逐舰“时雨”被编入了一支新的舰队。这支舰队被称为“第一游击部队 第三部队”（1YB3H）。但此舰队几乎能用“东拼西凑”来形容：舰队成员仅有被配置于后方的旧式战舰“山城”、“扶桑”，唯一的航空巡洋舰“最上”，以及四艘驱逐舰。作为集中剩余部队的战力，凭一战来逆转局势起死回

在剧场版动画「舰队Collection」的官网上，公开了一段特报视频。在这段45秒的视频之中，收录了舰娘们战斗的场面，TV版登场的吹雪、睦月、夕立之外，鸟海、加古等也一并登场.

　　故事发生在虚构的未来世界，彼时，人类因为疏忽和大意而失去了制海权，海洋，成为了人们可望而不可即的所在，盘踞在那里的，是一股名为“深海栖舰”的强大势力。为了同这股势力抗争，一群名为“舰娘”的女孩子们出现了，在她们的体内，栖息着舰艇之魂，亦是明日呢化身成为各式各样的战舰，为了人类的和平做着不懈的努力。 　　平日里，舰娘们在名为“镇守府”的大本营里进行日常生活和训练，某日，一位名叫吹雪（上坂堇 配音）的活泼女孩出现在了大家的面前，初来乍到的她踌躇满志，热情满满地加入了舰队的新生活中去，在这里，充满了精彩和