2112年新人监视官常守朱和执行官狡噛慎也与以前发生的恶性案件的幕后黑手槙岛圣护相遇。槙岛圣护动摇了维持和平的系统的根基，质疑正义的存在。最后，狡啮对他执行了自己的正义，从此消失无踪…… 　　2116年，日本政府开始向战乱国输入“Sibyl系统”和无人驾驶机器人，企图让这个系统控制全世界。他们在处于内战状态的SEAUn(东南亚诸国)实验性地导入了Sibyl系统，令其治理下的水上都市“香巴拉弗洛特”短暂地得到了平稳和安定的生活。但是，SEAUn却向日本派出了恐怖分子。恐怖分子偷偷潜入香巴拉弗洛特，企图

　　舞台是19世纪末。阿尔比恩王国由于共和革命而分裂。被巨大的墙壁分断的首都伦敦，东侧由王国、西侧由共和国统治，成为各国间谍活跃的暗影战争最前线。 　　革命之后10年，王国名门梅菲尔女王校出现了以女高中生为伪装、身为共和国间谍而活动的5名少女。阻止了女王暗杀未遂事件，结束了在卡萨布兰卡休养的她们，接到了Control下达的新指令。 　　以这一任务为契机，5名少女——Team白鸽开始被卷入动摇全国的巨大漩涡中——。